Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HmmrQ00547 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HmmrQ00547 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HmmrQ00547 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmmrQ00547 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmmrQ00547 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmmrQ00547 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmmrQ00547 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmmrQ00547 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmmrQ00547 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmmrQ00547 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmmrQ00547 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmmrQ00547 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmmrQ00547 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HmmrQ00547 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms