Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PgrQ00175 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PgrQ00175 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PgrQ00175 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PgrQ00175 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PgrQ00175 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PgrQ00175 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PgrQ00175 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PgrQ00175 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms