Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IhhP97812 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IhhP97812 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IhhP97812 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IhhP97812 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IhhP97812 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IhhP97812 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IhhP97812 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IhhP97812 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IhhP97812 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IhhP97812 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IhhP97812 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IhhP97812 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IhhP97812 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IhhP97812 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms