Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cry1P97784 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms