Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smyd1P97443 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms