Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SmsP97355 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SmsP97355 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SmsP97355 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SmsP97355 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SmsP97355 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SmsP97355 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SmsP97355 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SmsP97355 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmsP97355 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmsP97355 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmsP97355 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SmsP97355 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmsP97355 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmsP97355 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmsP97355 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmsP97355 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmsP97355 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmsP97355 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmsP97355 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmsP97355 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmsP97355 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms