Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3aP97351 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms