Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mesp1P97309 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms