Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx3P81067 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx3P81067 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx3P81067 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx3P81067 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Irx3P81067 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Irx3P81067 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms