Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr1bP70700 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr1bP70700 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms