Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctps1P70698 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctps1P70698 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms