Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irf3P70671 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irf3P70671 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms