Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx3P70354 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx3P70354 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msx3P70354 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Msx3P70354 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms