Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitx1P70314 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitx1P70314 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms