Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd13P70217 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd13P70217 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms