Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Acta1P68134 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Acta1P68134 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Acta1P68134 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Acta1P68134 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Acta1P68134 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Acta1P68134 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Acta1P68134 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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