Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpnP63163 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms