Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Lmo4P61969 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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