Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Copz1P61924 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Copz1P61924 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copz1P61924 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms