Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnnP61807 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnnP61807 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnnP61807 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SnnP61807 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnnP61807 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnnP61807 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SnnP61807 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnnP61807 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnnP61807 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnnP61807 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnnP61807 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnnP61807 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnnP61807 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnnP61807 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnnP61807 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnnP61807 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms