Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abce1P61222 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abce1P61222 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms