Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdo1P60334 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdo1P60334 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms