Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tpm2P58774 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tpm2P58774 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms