Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dpf3P58269 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms