Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NcstnP57716 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NcstnP57716 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms