Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gsc2P56916 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gsc2P56916 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms