Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtskP55097 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtskP55097 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtskP55097 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtskP55097 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtskP55097 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms