Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CnbpP53996 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms