Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PctpP53808 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PctpP53808 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PctpP53808 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PctpP53808 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PctpP53808 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms