Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RabggtbP53612 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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