Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp10P52479 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp10P52479 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp10P52479 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Usp10P52479 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms