Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ClgnP52194 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClgnP52194 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms