Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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CcnfP51944 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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CcnfP51944 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CcnfP51944 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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CcnfP51944 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CcnfP51944 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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