Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc4P51655 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms