Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pa2g4P50580 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms