Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx3P50481 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms