Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdhaP50136 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdhaP50136 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms