Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psen1P49769 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms