Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb42P49222 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb42P49222 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb42P49222 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Epb42P49222 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Epb42P49222 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epb42P49222 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms