Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp3P49194 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp3P49194 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms