Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CitP49025 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CitP49025 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CitP49025 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CitP49025 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CitP49025 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CitP49025 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CitP49025 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CitP49025 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CitP49025 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CitP49025 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CitP49025 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CitP49025 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CitP49025 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CitP49025 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms