Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnni3P48787 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms