Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptx3P48759 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms