Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rph3aP47708 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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