Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms