Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msh2P43247 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msh2P43247 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms