Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Traf1P39428 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf1P39428 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms