Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TtlP38585 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TtlP38585 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtlP38585 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtlP38585 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtlP38585 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtlP38585 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms