Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sar1aP36536 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sar1aP36536 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms