Protein–RNA interactions for Protein: P35951

Ldlr, Low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdlrP35951 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LdlrP35951 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LdlrP35951 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LdlrP35951 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LdlrP35951 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LdlrP35951 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LdlrP35951 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms